Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vax1Q2NKI2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms