Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
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Shroom4Q1W617 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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Shroom4Q1W617 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
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Shroom4Q1W617 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
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Shroom4Q1W617 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom4Q1W617 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
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Shroom4Q1W617 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
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