Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLK6

B3gnt4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt4Q1RLK6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms