Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim71Q1PSW8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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