Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms