Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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Fam171bQ14CH0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Fam171bQ14CH0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Fam171bQ14CH0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Fam171bQ14CH0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Fam171bQ14CH0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Fam171bQ14CH0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam171bQ14CH0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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