Protein–RNA interactions for Protein: Q14C37

Lemd1, LEM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd1Q14C37 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lemd1Q14C37 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd1Q14C37 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms