Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Rpusd2Q149F1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Rpusd2Q149F1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Rpusd2Q149F1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Rpusd2Q149F1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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