Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VgfQ0VGU4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VgfQ0VGU4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms