Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms