Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid2Q0VBB0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prelid2Q0VBB0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms