Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntnap5bQ0V8T8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.6 ms