Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vps8Q0P5W1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms