Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms