Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms