Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Znf541Q0GGX2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms