Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms