Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kcnma1Q08460 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms