Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms