Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms