Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms