Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms