Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms