Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnb1Q03717 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms