Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs2Q03350 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs2Q03350 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms