Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms