Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms