Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax5Q02650 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms