Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms