Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JupQ02257 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JupQ02257 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JupQ02257 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JupQ02257 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JupQ02257 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms