Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms