Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snai1Q02085 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms