Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd1Q01822 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms