Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms