Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HmgcrQ01237 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms