Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms