Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoa1Q00623 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms