Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms