Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stx2Q00262 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms