Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms