Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
VldlrP98156 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
VldlrP98156 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VldlrP98156 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VldlrP98156 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VldlrP98156 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VldlrP98156 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VldlrP98156 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VldlrP98156 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms