Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcc1P97496 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms