Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smyd1P97443 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms