Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim43bP86448 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim43bP86448 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms