Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms