Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnikP83510 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnikP83510 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnikP83510 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnikP83510 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnikP83510 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnikP83510 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TnikP83510 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TnikP83510 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TnikP83510 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnikP83510 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnikP83510 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnikP83510 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TnikP83510 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TnikP83510 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnikP83510 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnikP83510 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnikP83510 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnikP83510 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TnikP83510 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TnikP83510 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TnikP83510 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TnikP83510 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TnikP83510 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TnikP83510 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TnikP83510 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TnikP83510 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TnikP83510 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TnikP83510 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TnikP83510 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TnikP83510 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TnikP83510 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TnikP83510 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TnikP83510 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TnikP83510 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TnikP83510 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TnikP83510 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TnikP83510 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TnikP83510 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TnikP83510 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TnikP83510 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TnikP83510 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TnikP83510 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TnikP83510 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TnikP83510 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TnikP83510 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TnikP83510 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms