Protein–RNA interactions for Protein: P81270

Erg, Transcriptional regulator ERG, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErgP81270 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErgP81270 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErgP81270 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErgP81270 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErgP81270 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErgP81270 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErgP81270 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErgP81270 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ErgP81270 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ErgP81270 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ErgP81270 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ErgP81270 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ErgP81270 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ErgP81270 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ErgP81270 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ErgP81270 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ErgP81270 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ErgP81270 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ErgP81270 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ErgP81270 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms