Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx1P81068 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx1P81068 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms