Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8a1P70704 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp8a1P70704 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms