Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb1P70662 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb1P70662 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb1P70662 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb1P70662 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb1P70662 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb1P70662 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb1P70662 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb1P70662 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb1P70662 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb1P70662 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb1P70662 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb1P70662 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb1P70662 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb1P70662 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms